A l’issue de l’opération Torch, les forces maritimes d’Afrique (giraudistes) et les Forces Navales Françaises Libres (gaullistes) fusionnent le 3 août 1943. Si l’organisation des forces navales est adaptée à la nouvelle situation, en revanche, l’organisation administrative, de gestion et de défense des installations et des unités portuaires demeurent en l’état. Dans ce contexte l’entité connue sous le nom de « Marine Alger » et Marine Bône » prend en compte la gestion des unités à terre et des moyens de fonctionnement et de défense des ports implantés dans ces localités.